a chunk of hair-covered animal flesh sits on a white plastic pedestal

L’un des derniers rhinocéros laineux à avoir marché sur Terre a été mangé par un bébé loup – et les scientifiques ont maintenant séquencé son génome à partir de la viande non digérée.

Par Anissa Chauvin

Les scientifiques ont analysé le génome d’un rhinocéros laineux vieux de 14 400 ans à partir d’un morceau de chair trouvé dans l’estomac d’un ancien bébé loup. Les résultats donnent aux experts un aperçu de l’extinction du rhinocéros laineux, qui s’est probablement produite rapidement en raison de changement climatique.

Le rhinocéros laineux (Coelodonta antiquitatis) des tissus ont été trouvés à l’intérieur des restes momifiés d’un louveteau, initialement découvert dans le pergélisol sibérien en 2011. Une autopsie ultérieure du chiot a révélé son dernier repas: Il a dîné sur l’un des derniers rhinocéros laineux de la Terre. Mais maintenant, les scientifiques ont trouvé comment séquencer le génome complet de l’animal à partir de morceaux de chair de rhinocéros non digérés.

« Le séquençage complet du génome d’un animal de la période glaciaire trouvé dans l’estomac d’un autre animal n’a jamais été réalisé auparavant », Camilo Chacón-Duquebioinformaticien à l’Université d’Uppsala en Suède et co-auteur de la nouvelle étude, a déclaré dans un communiqué.

Dans la nouvelle recherche, publiée mercredi 14 janvier dans la revue Biologie et évolution du génomeles chercheurs ont analysé le tissu musculaire laineux du rhinocéros et l’ont comparé à des exemples plus anciens pour étudier la taille de la population de l’espèce et son niveau de consanguinité juste avant son extinction. Ce morceau de viande a fourni des informations sans précédent sur la disparition du rhinocéros laineux.

De nombreuses espèces en voie de disparition laissent des indices sur leur déclin dans leur aire de répartition géographique, la taille de leur population et leur génome. À mesure que les populations d’un animal diminuent, elles peuvent se concentrer dans une zone particulière. Par exemple, mammouths laineux (Mammuthus primigenius) a persisté jusqu’il y a environ 4 000 ans sur une île isolée de Sibérie. Mais leur petite population a contribué à la consanguinité, et ce manque de diversité génétique a peut-être finalement condamné le mammouth. (Bien qu’une autre étude suggère que ces mammouths insulaires sont morts dans un mystère aléatoire événement.)

Le rhinocéros laineux, cependant, était répandu dans le nord de l’Eurasie jusqu’il y a environ 35 000 ans. Son aire de répartition géographique s’est réduite au fil du temps et l’espèce s’est concentrée dans le nord-est de la Sibérie, avant de disparaître il y a environ 14 000 ans. Le morceau de tissu de rhinocéros laineux découvert dans l’estomac du louveteau a été daté au carbone 14 400 ans en arrière, ce qui signifie que le rhinocéros laineux était probablement l’un des derniers de son espèce.

Les chercheurs ont généré le génome du rhinocéros laineux à partir du tissu musculaire préservé et l’ont comparé à deux génomes plus anciens datés d’il y a 18 000 et 49 000 ans. Ils ont découvert que les trois rhinocéros avaient des niveaux similaires de consanguinité et de diversité génétique, ce qui suggère qu’il existait une population de rhinocéros laineux relativement stable dans le nord de la Sibérie jusqu’il y a au moins 14 400 ans, et que leur extinction a dû se produire rapidement par la suite.

« Nos résultats montrent que les rhinocéros laineux avaient une population viable pendant 15 000 ans après l’arrivée des premiers humains dans le nord-est de la Sibérie, ce qui suggère que le réchauffement climatique, plutôt que la chasse humaine, a provoqué l’extinction », co-auteur de l’étude. J’adore Dalénprofesseur de génomique évolutionniste au Centre de paléogénétique en Suède, a déclaré dans le communiqué. Les résultats s’appuyer sur des travaux antérieurs par plusieurs des mêmes chercheurs.

Des changements rapides dans le climat mondial se sont produits vers la fin du Époque du Pléistocène (la dernière période glaciaire) et de nombreux grands mammifères ont disparu. La disparition du rhinocéros laineux s’aligne sur une période appelée interstade Bølling-Allerød, qui impliquait un réchauffement brutal du climat de l’hémisphère nord il y a environ 14 700 à 12 900 ans. Ce climat considérablement plus chaud a peut-être anéanti les aliments préférés des rhinocéros laineux herbivores adaptés au froid et a ainsi contribué à leur déclin rapide.

Même si le nouveau génome ne résout pas tous les mystères entourant l’extinction du rhinocéros laineux, les chercheurs ont démontré qu’il est possible de récupérer l’ADN d’un animal à l’intérieur d’un autre.

« C’était vraiment excitant, mais aussi très difficile, d’extraire un génome complet à partir d’un échantillon aussi inhabituel », a déclaré l’auteur principal de l’étude, Sólveig Guðjónsdóttir, chercheur à l’Université de Stockholm, dans le communiqué.

Les chercheurs espèrent que leurs réalisations ouvriront la voie à de futures analyses ADN et génomiques de tissus animaux provenant de « sources improbables ».


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Anissa Chauvin