L’évolution des céphalopodes comporte depuis longtemps un chapitre manquant dans son histoire : comment des ancêtres ressemblant à des calamars ont-ils donné naissance aux poulpes d’aujourd’hui ? Il s’avère que la réponse a toujours été de flotter dans les profondeurs de la mer.
Avec ses yeux fantomatiques brillants, huit bras comme ses cousins poulpes et une coloration rubis foncé assortie, l’insaisissable calmar vampire (Vampyroteuthis infernalis) a enfin révélé ses secrets génétiques.
Dans une étude publiée le 27 novembre dans la revue iScienceles chercheurs ont séquencé le génome de Vampyrotheuthis et découvert que ses chromosomes ressemblent toujours à ceux des calmars et des seiches, bien qu’ils appartiennent à l’ordre des poulpes. Cette découverte fait allusion à ce que l’ancêtre commun des calmars et des calmars modernes poulpes cela a peut-être ressemblé au niveau génétique Il y a 300 millions d’années lorsque le poulpe et le calmar ont divergé au cours de l’évolution. Les chercheurs ont décrit le calmar vampire comme un « fossile vivant ».
Sur l’arbre évolutif des céphalopodes, le calmar vampire appartient au groupe qui comprend les poulpes, mais a subi une « séparation très ancienne » du reste du clade, auteur principal de l’étude Oleg Simakovchercheur au Département de neurosciences et de biologie du développement de l’Université de Vienne, en Autriche, a déclaré à Live Science dans un e-mail.
Après avoir acquis un échantillon de tissu d’un calmar vampire collecté comme prise accessoire dans l’océan Pacifique occidental lors d’une croisière de recherche, les chercheurs ont utilisé une plate-forme d’analyse génétique appelée PacBio pour séquencer l’ADN de l’échantillon. Malheureusement, il n’existait aucun autre échantillon de calmar vampire auquel le comparer, en raison de leur rareté. Grâce à PacBio, les chercheurs ont comparé le génome du calmar vampire à celui d’autres céphalopodes comme l’Argonaut (Argonaute hians), la pieuvre commune (Poulpe vulgaris) et le poulpe frisé (Élédone cirrhosa).
Les résultats ont révélé que le calmar vampire possède un génome de 11 milliards de paires de bases, soit près de quatre fois celui du calmar vampire. taille du génome humain – et le plus grand génome de céphalopode séquencé à ce jour.
Alors que les poulpes modernes ont un ADN qui est constamment remanié, ce qui entraîne un certain mélange chromosomique, les chercheurs ont découvert que le génome du calmar vampire conservait une grande partie de son arrangement chromosomique ancestral, semblable à celui du calmar. Il s’agit essentiellement d’un octopode qui ressemble génétiquement à un ancien calmar.
Le calmar vampire a une longue histoire d’incompréhension. Quand c’était initialement découvert en 1903on pensait qu’il s’agissait d’une pieuvre cirrate en raison de sa sangle unique entre ses bras. Cependant, dans les années 1950, les scientifiques l’ont reclassé comme un groupe à part entière, n’appartenant ni au poulpe ni au calmar, mais dans l’ordre Vampyromorphidaeainsi nommé parce qu’il semble porter une cape semblable à celle d’un vampire.
Cette découverte est une bonne nouvelle pour les scientifiques sur les céphalopodes, car il est « agréable d’avoir compris » pourquoi les calmars vampires conservent une grande partie de leurs caractéristiques ancestrales, semblables à celles des calmars, a déclaré Bruce Robisonscientifique principal au Monterey Bay Aquarium Research Institute (MBARI), qui n’a pas participé à la recherche.
Une partie de ce qui rend le génome entièrement séquencé si précieux est la difficulté d’étudier les calmars vampires, principalement « parce qu’ils vivent dans un habitat difficile d’accès, qu’ils sont solitaires, rares et ne survivent pas bien en captivité », a déclaré Robison. « Certaines personnes pensent que nous pouvons simplement plonger dans les eaux profondes et en trouver une quand bon nous semble, ce qui n’est certainement pas le cas. »
Il a ajouté que les résultats « renforcent l’idée que certains d’entre nous pensent que les vampires seraient la clé du puzzle. Ils sont intéressants à étudier parce que ce sont des animaux vraiment cool et parce qu’ils ont l’air de cacher des secrets ».
