Les «superbacient» bactériens peuvent gagner une résistance aux antibiotiques car les microbes infectaient activement une personne. Maintenant, une nouvelle étude suggère que les traitements pour ces infections graves pourraient être améliorés en suivant ces changements génétiques au fur et à mesure qu’ils se déroulent dans les bactéries.
« Notre étude est la première à montrer qu’en suivant l’évolution bactérienne en temps réel, le séquençage du génome peut révéler que les bactéries sont utilisées pour survivre, donnant aux médecins le pouvoir de garder une longueur d’avance et de faire un traitement à la souche bactérienne spécifique », co-auteur de l’étude Dr Stefano Giulieriun chercheur clinicien et médecin de maladie infectieux au Doherty Institute de Melbourne, en Australie, a déclaré dans un déclaration.
L’étude, publiée en mai dans la revue Communications de la natureaxé sur Staphylococcus aureus. Cette bactérie est transportée par environ 30% des personnes et ne fait souvent aucun mal, mais si elle suit et déclenche une infection, elle peut devenir résistante aux traitements antibiotiques. Lorsque les bactéries résistent à plusieurs antibiotiques, ils sont considérés Superbugs dangereux.
Pour traiter avec succès une infection superbe, il est utile de savoir s’il s’agit d’une infection « persistante » ou « récurrente ». Dans une infection persistante, un patient continue de tester positif même après cinq jours ou plus de traitement. Dans une infection récurrente, le patient réagit initialement bien au traitement mais teste ultérieurement positif pour les bactéries, soit avec la même souche ou un nouveau type. Comprendre le type d’infection peut aider à diriger le traitement en guidant le choix des médicaments des médecins.
Pour voir si des analyses génétiques pourraient aider à guider ces décisions, les chercheurs ont analysé S. aureus Échantillons de 11 patients dont les traitements antibiotiques échouaient. Cela comprenait 60 souches différentes de la bactérie.
À l’aide d’analyses génétiques, l’équipe de recherche a identifié si les échantillons de chaque patient contenaient des bactéries des mêmes souches ou de souches génétiquement distinctes. Ensuite, ils ont effectué des tests pour repérer des signatures d’évolution adaptative, ce qui signifie que les signes que les microbes ramassaient des traits qui les aideraient à mieux survivre. L’évolution adaptative permet aux bactéries de survivre même avec des antibiotiques présents.
Environ un tiers des souches échantillonnées ont montré des signes d’évolution adaptative, en particulier dans les gènes précédemment liés à la résistance aux antibiotiques. Cela suggère que les traitements antibiotiques des patients devraient être passés à un médicament auquel les bactéries n’étaient pas résistantes.
Mais une question est restée: ces informations seraient-elles réellement utiles aux médecins car ils traitaient des infections super abondantes?
Pour enquêter, les scientifiques ont créé une enquête basée sur les 11 cas de patients, y compris les descriptions avec et sans l’analyse de l’évolution. Ils ont recruté 25 médecins de maladie infectieux du monde entier pour répondre à l’enquête. Lorsqu’on lui donne le rapport d’évolution, 34% des médecins ont modifié leurs suggestions d’antibiotiques d’origine, le changement d’antibiotiques et / ou l’ajustement de la durée des patients sont restés sur le même médicament.
Ces résultats suggèrent que, dans la pratique clinique réelle, le suivi de l’évolution bactérienne pourrait améliorer les évaluations des médecins de l’échec des antibiotiques et des décisions de traitement ultérieures.
Bien que la nouvelle étude ait certaines limites, telles que sa petite taille d’échantillon, elle fournit une « preuve de concept » pour l’utilisation d’analyses évolutives comme outil pour lutter contre les infections résistantes aux antibiotiques, les auteurs de l’étude ont écrit dans leur rapport.
« Cet outil peut avoir un impact significatif sur notre processus de prise de décision », a déclaré Dr Quyen Nguyenprofesseur adjoint de médecine à l’Université de Pittsburgh qui n’a pas été impliqué dans la recherche. « Par conséquent, nous accueillons de nouvelles technologies qui peuvent rapidement fournir des données plus précises afin que nous puissions accroître la confiance dans nos décisions », a déclaré Nguyen à Live Science dans un e-mail.
Actuellement, le délai de coût et le délai d’exécution du séquençage génomique sont encore des obstacles à l’utilisation régulière de cette approche avec les patients. Les études futures devront expliquer comment le cadre pourrait être appliqué au mieux et explorer son utilisation dans de plus grands groupes de patients, ont conclu les auteurs de l’étude.
Cet article est à des fins d’information uniquement et n’est pas censé offrir des conseils médicaux.
