Quelles sont les lignées fantômes, vestiges du passé qui existent encore aujourd’hui dans notre ADN ?

Quelles sont les lignées fantômes, vestiges du passé qui existent encore aujourd’hui dans notre ADN ?

Par Anissa Chauvin

Les « lignées fantômes » peuvent sembler paranormales, mais le terme est ancré dans la science réelle que les études génétiques n’ont révélé que relativement récemment.

Alors, qu’est-ce qu’une lignée fantôme ?

Chez les animaux en général, et pas seulement chez les humains, la découverte de lignées fantômes s’est faite « en grande partie par accident ». J’adore Dalénun généticien évolutionniste de l’Université de Stockholm qui étudie les animaux disparus, a déclaré à Live Science. « Nos objectifs étaient d’étudier l’évolution des mammouths, des bovidés et des lemmings, et la découverte de ces lignées fantômes était assez inattendue. »

Dans leurs analyses de l’Antiquité ADN récupérés à partir des fossiles congelés d’animaux clés de la période glaciaire qui sont maintenant éteints, notamment mammouthsPléistocène les yaks et certains types de lemmings — Dalén et ses collègues ont détecté plusieurs populations anciennes qui n’ont été révélées que par génétique.

Ces lignées fantômes indiquent que la diversité génétique – la gamme de traits hérités au sein d’une population – était plus grande au cours de la période dernière période glaciaire qu’elle ne l’est maintenant. « C’est certainement une tendance que nous observons chez les espèces arctiques qui sont vivantes aujourd’hui », a déclaré Dalén. « Presque tous avaient une diversité génétique beaucoup plus élevée dans le passé, et pour moi, cela illustre à quel point le passé est important. changement climatique a contribué à façonner la biodiversité actuelle.

Mais les lignées fantômes sont trop importantes pour être laissées au hasard. « Il devient de plus en plus clair que nous devons utiliser une approche fondée sur l’ADN ancien pour quantifier pleinement les changements passés de la biodiversité », a déclaré Dalén.

« Fantômes » humains

Les fantômes génétiques de l’évolution humaine sont particulièrement intéressants pour les scientifiques car ils révèlent une histoire de l’évolution humaine beaucoup plus complexe que ne le supposaient de nombreux experts.

Les lignées fantômes détectées dans les génomes des humains modernes et nos parents disparus ont révolutionné l’étude de millions d’années de évolution humaine.

La plupart des scientifiques pensaient autrefois que l’évolution humaine avait progressé à un rythme constant à travers les étapes connues, culminant avec l’émergence de Homo sapiens en Afrique il y a environ 300 000 ans et son éventuel remplacement de tous d’autres formes d’humainsavec quelques croisements limités.

Mais les analyses génétiques des deux dernières décennies ont a révélé des traces de plusieurs lignées de fantômes humains dans l’ascendance des gens d’aujourd’hui et dans l’ADN ancien récupéré à partir de fossiles. Ces lignées de fantômes humains sont des échos de groupes archaïques qui ont existé pendant des centaines de milliers, voire des millions d’années, mais qui n’ont laissé aucun fossile connu.

« Notre discipline est passée d’un modèle d’évolution linéaire simplifié et direct à un modèle plus » touffu « pour décrire les 7 derniers millions d’années. » Michael Petragliapaléoanthropologue à l’Université Griffith en Australie, a déclaré à Live Science dans un e-mail.

L’« arbre » de l’évolution humaine est devenu de plus en plus grand et de moins en moins bien défini, se transformant en un « flux tressé » de groupes anciens – à mesure que de plus en plus de lignées fantômes ont été identifiées, a-t-il déclaré, et cela continue de croître.

Quand les nouveaux fossiles correspondent à la « génétique fantôme »« , les lignées deviennent « dé-fantômes », et la dé-fantôme des lignées de fantômes humains est un domaine de recherche important. « Avec l’application de l’ADN, il est devenu clair que des lacunes dans notre évolution existaient, suggérant la présence de populations fantômes pour lesquelles les archives fossiles n’étaient pas clairement présentes », a déclaré Petraglia.

Ancêtres « superarchaïques »

Les scientifiques ont observé des traces de lignées de fantômes humains dans le génome de certaines populations humaines modernes dans certaines régions d’Afrique de l’Ouest, d’Asie et d’Asie. Océanieet Petraglia a déclaré que la recherche paléoanthropologique s’est concentrée sur un groupe de « superarchaïque » des hominidés connus uniquement à partir de leurs gènes.

Cette ancienne lignée de fantômes humains séparée de notre propre arbre généalogique des humains modernes, Néandertaliens et Dénisoviens il y a environ 2 millions à 1,8 million d’années – à peu près quand Homo érectus était l’espèce dominante en Afrique.

Il n’existe aucun fossile de la lignée des fantômes superarchaïques, les scientifiques ont donc seulement déduit son existence de la présence de gènes fantômes dans leurs analyses sur Néandertal, Denisovan et H. sapiens génomes.

Mais le tableau est compliqué en raison de la confusion créée par les métissages. « Les travaux génétiques suggèrent que les ancêtres des Dénisoviens, des Néandertaliens et des Homo sapiens se sont rencontrés et se sont croisés à plusieurs reprises », a déclaré Petraglia. « Cela a déclenché un débat quant à la recherche du dernier ancêtre commun et comprendre la lignée des descendants.

Il existe des preuves génétiques que les Dénisoviens croisé avec la lignée superarchaïque dans au moins deux événements de croisement distincts, ce qui entraîne un nombre relativement élevé de gènes « fantômes » de la lignée humaine superarchaïque dans les génomes des Dénisoviens et ceux des humains modernes d’ascendance Dénisovienne.

« Nous vivons une période passionnante dans les études sur l’évolution humaine, et il existe un consensus croissant selon lequel l’évolution des hominidés était beaucoup plus complexe qu’on ne l’imaginait auparavant, y compris de multiples événements de croisement qui font de nous ce que nous sommes aujourd’hui », a déclaré Petraglia.


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Anissa Chauvin